同色異譜現象對商品包裝印刷有很大的影響。例如，在印刷包裝中，許多出廠前印刷精美的包裝盒，顏色一致，準確無誤，而到了各大商店或用戶手中，卻發現顏色差異較大。這些都會使用戶懷疑商品的真偽，要求退貨甚至投訴，自然商家信譽亦受到損壞，而實際上這種現象就是印刷中產生同色異譜現象引起的，并非假冒商品，但消費者不明白其中的原因，因此，在包裝印刷中就要注意這個問題。

同色異譜現象在包裝印刷中是很難避免的，只能想辦法加以控制。我們知道，在印刷中印刷品的最終色彩效果是靠油墨和承印物（如紙張）決定的，因此它們也是產生同色異譜現象的主要因素，所以要在這兩個方面加以注意。在油墨方面，由于現代包裝印刷向著多色、防偽等方向發展，除了黃、品、青、黑基礎色外，專色越來越多。而不同批的專色墨印刷后就易出現同色異譜，所以在專色墨調制中要特別注意這個問題，它是影響質量的一個重要因素。還有，普通的四色印刷由于使用不同批次的油墨，盡管印刷色序等條件相同，也會產生同色異譜現象。因此不管專色或四色印刷，印刷時要盡量使用同一品牌同一批次的油墨，當發現同色異譜時，及時向供應商反映，要求其提供相同的油墨，以盡量減少或控制同色異譜現象。

但在實際上的包裝裝潢印刷中，由三原色油墨配專色或三原色網點面積率配專色等，都會存在一定色差。對于包裝裝潢印刷來說，應允許復制品與標準樣品（原稿）在做同色異譜色匹配時存在色差，只是應盡量控制復制品與原稿的色差值，把它限制在規定的允許范圍之內。在紙張（尤其是色紙）方面，紙張的性質對油墨印刷所呈現的色彩有很大影響，即同一種油墨印刷在不同的紙張上會產生不同的色彩效果。其中影響油墨印刷色彩差異的主要因素有紙張的白度、亮光度、吸收性等。紙張顏色等性能的差異也會產生同色異譜現象，因此，在生產紙張時，做到與標準樣的顏色相同、性能參數一致是非常重要的。但由于目前造紙企業在進行顏色的質量控制時，多數只用一種觀測條件下的色差值來評價顏色的等色程度，而不考慮同色異譜問題。因此，在印刷中，一個產品要盡可能使用同批次同廠商的紙張，以減少和控制紙張引起的同色異譜現象。與客戶看樣時，觀察色稿與試樣必須在同一標準光源下進行，避免因不同光源造成的色彩出現偏差，這些都要在印刷中加以注意。